Когда-то русло Сены пролегало иначе и весь правый берег современного Парижа находился под водой. В XI веке н.э. болотистые земли правого берега Парижа засадили огородами. С тех пор, слова с корнем "марэ" во французском языке имеют двойное значение — болото и огород.

Когда-то здесь находилась главная европейская резиденция и крепость могущественного ордена тамплиеров «Тампль». Вокруг крепости с 13 века селились евреи. В наши дни в районе улицы Розье можно встретить традиционных евреев, носящих белые рубшки, черные костюмы, шляпы и пейсы.


В 12 веке, в начале 100 летней войны в Марэ была построена первая королевская резиденция, для Карла V, который предпочитал жить рядом с новой крепостью Бастилия. Рездинция назвали Сен-Поль.

В районе современной площади Вогезов, которая когда-то называлась Королевской, построенной по указанию Генриха IV, находился второй королевский дворец Марэ — резиденция Турнель.

Дворец Турнель был покинут двором после несчастного случая, произошедшего с королем Генрихом II — супругом Екатерины Медичи. Король участвовал в игровом поединке, рыцари сражались деревянными копьями. Осколок копья рыцаря Монтгомери попал через забрало доспехов прямо в глаз короля, который умер в тяжелых мучениях через неделю после поединка.

После того, как двор Людовика XIV переехал в Парижский пригород Версаль — некогда аристокартический квартал Марэ был предан забвению. Так, в особняке епископов Санских, где когда-то жила первая супруга Генриха Четвертого Королева Марго, находился консервный завод. Многие другие роскошные особняки были разделены на небольшие квартиры-каморки.

Барон Осман, префект Наполена III, перестроивший Париж в середине 19 века, не успел добраться до квартала Марэ, поэтому в этой части Парижа больше всего узких и извилистых улочек и фахверковых домов, благодаря которым мы можем представить то, как выглядел Париж в средние века.

В 60е годы прошлого столетия очень многое для Марэ сделал министр культуры Андрэ Мальро. Благодаря его стараниям были расселены и отреставрированы особняки 17 века — в особняке Сале, сейчас расположен музей П. Пикассо, во дворце Роганов-Субиз — национальные архивы, в особняке Бове — административный суд, в особняке Карнавале — музей истории города Парижа, в особняке Санс — бибиотека Форней.